WCR推出阿拉比卡基因识别数据库!

来源:中国咖啡网: 咖啡新闻 > 作者:GFD 2024-05-22 我要评论

2021~2023年间,世界咖啡研究组织(WCR)在拉丁美洲和非洲对常见的阿拉比卡咖啡品种进行采样,并与瑞典的Intertek Agritech实验室合作,对样品进行基因分型,建立样本的SNP指纹图谱,并开发了参考数据库

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何为SNP标记?

SNP(单核苷酸多样性)是一种分子遗传标记,是研究植物品系遗传变异的重要依据,这些微小的变异作为一串标记分布在植物的DNA序列中,可以用来创建一个品种的遗传“指纹”。

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收集咖啡叶样本进行遗传分析

怎么通过SNP检测咖啡遗传性

如果生产商想要检查咖啡树的遗传纯度,以确保他们是正确的品种,需要从想要鉴定的咖啡树上采集下一片小叶子,并把它送到基因分型实验室,从叶片样本中提取DNA,读取SNP图谱,接着将样本的SNP指纹与相关品种的已知SNP指纹进行比较,当指纹匹配时,就可以确认品种。

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WCR表示:目前植物遗传测试因为价格昂贵,成本高还无法大规模用于咖啡行业,而缺乏品种验证可能会导致某些商业咖啡品种被生产商或者下游的供应链参与者误识别。过去有一项关于“遗传整合”的研究发现,在88个待鉴定是否是瑰夏品种咖啡的样本实验当中,只有61%的咖啡树在遗传上是一致的(这意味着39%不符合该品种的预期遗传图谱)。这种“遗传不一致”可能给农民带来毁灭性的经济后果,例如农民可能种植了一种所谓的抗病品种,但最终它在遗传上不一致,更容易受到病害感染。

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创造低成本、快速的基因分型工具有助于全球咖啡供应链参与者识别和跟踪生产过程中的咖啡品种,所以该数据库最重要的应用之一是开发低成本的品种认证,目前涵盖了23个常见品种,无限制地对公众开放。WCR计划在未来几个月和几年内增加更多品种的SNP指纹。

数据库涵盖的咖啡品种

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该数据库可以帮助咖啡行业的相关人士更好地识别和保护不同品种的阿拉比卡咖啡豆,并为咖啡鉴定人员提供准确的参考资料。咖啡供应商和研究机构可以通过该数据库进行低成本、高质量的基因分型,用于育种和种子质量控制,种子供应商和育苗场能够为咖农提供足够数量的基因纯正和健康的幼苗,这将增加咖农获得改良的、适应性强的品种的机会,从而提高产量和利润。

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2023-10-02 18:59:07

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